GenCRISPR HDR敲入模板设计工具

输入序列

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输出序列

选择编辑位置：

• 绿色竖线标签表示编辑位点。
• 当鼠标放置在绿色标签或其两端，并变为十字形状时，按住鼠标左键可调整绿色标签左右两端的位置，选择合适的编辑位置。

浏览序列谱图：

• 将鼠标放在序列图上，点击并滚动鼠标滚轮，可以放大序列谱图，显示每个碱基和氨基酸。
• 按住鼠标左键可将序列谱图自由向左或向右移动。

默认同源臂长度信息

当删除序列的长度≤70bp

• 针对≤100bp的敲入序列，同源臂长度默认为70nt
• 针对＞100bp的敲入序列，同源臂长度默认为300nt
• 金斯瑞建议如果敲入序列长度≤2kb，选择ssDNA，推荐同源臂长度设置为250nt；选择dsDNA，推荐同源臂长度设置为150-200bp。如果敲入序列长度＞2kb，同源臂长度推荐设置为300-500bp

当删除序列的长度＞70bp

• 当删除序列的长度为70-299nt，同源臂长度默认为300nt
• 当删除序列的长度为300-499nt，同源臂长度默认为500nt
• 当删除序列的长度为500-1500nt，同源臂长度默认为700nt

排名是根据不同sgRNA的“与敲入位点的距离”，这个参数越小，排名越高。 如果“与敲入位点的距离”相同，sgRNA的“目标得分”越高，排名越高。 请根据您最重要的参数选择设计。